1、賬戶開辦方不同：零余額賬戶一般是指由財政部門為滿足部門以及單位的需求在銀行開設(shè)的賬戶，而基本存款賬戶則是由單位財政工作人員自行前往銀行開設(shè)的賬戶；

2、賬戶的用途不同：零余額賬戶主要是用來進(jìn)行財政支付和財政清算，而基本存款賬戶可以辦理公司的許多業(yè)務(wù)，包括工資的發(fā)放、日常業(yè)務(wù)的結(jié)算等等；

3、賬戶面向范圍不同：零余額賬戶一般是和政府相關(guān)的單位才能辦理，基本賬戶所有單位都能辦理。

零余額賬戶的管理使用

1、財政部門：國家的財政部門主要使用零余額賬戶進(jìn)行相關(guān)項(xiàng)目的財政支付；

2、預(yù)算單位：預(yù)算單位主要是按照相關(guān)部門的指令，使用零余額賬戶進(jìn)行規(guī)定額度內(nèi)的財政支付；

3、行政事業(yè)單位：行政事業(yè)單位主要負(fù)責(zé)零余額賬戶預(yù)算單位的賬務(wù)登記工作，如果預(yù)算單位將撥款用在購買物品或服務(wù)上，應(yīng)記為“行政支出”項(xiàng)目。